MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Alistipes shahii WAL 8301 draft genome

Total Repeats: 23269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_021030	GCC	2	6	3329616	3329621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21002	NC_021030	GTT	2	6	3329633	3329638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21003	NC_021030	CTG	2	6	3329639	3329644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21004	NC_021030	CTC	2	6	3329648	3329653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21005	NC_021030	GGTA	2	8	3329714	3329721	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21006	NC_021030	GCA	2	6	3329725	3329730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21007	NC_021030	CGG	2	6	3329748	3329753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21008	NC_021030	GAT	2	6	3329807	3329812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21009	NC_021030	CCGT	2	8	3329853	3329860	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21010	NC_021030	CTT	2	6	3329939	3329944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21011	NC_021030	CTC	2	6	3329987	3329992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21012	NC_021030	TGCA	2	8	3330065	3330072	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21013	NC_021030	N	1109	1109	3330105	3331213	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21014	NC_021030	CCG	2	6	3331239	3331244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21015	NC_021030	GCCC	2	8	3331249	3331256	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21016	NC_021030	CATC	2	8	3331351	3331358	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21017	NC_021030	GTC	2	6	3331361	3331366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21018	NC_021030	AGC	2	6	3331443	3331448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21019	NC_021030	TGC	2	6	3331484	3331489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21020	NC_021030	CAT	2	6	3331538	3331543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21021	NC_021030	AGT	2	6	3331546	3331551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21022	NC_021030	ATC	2	6	3331617	3331622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21023	NC_021030	ACGA	2	8	3331638	3331645	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21024	NC_021030	TCG	2	6	3331723	3331728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21025	NC_021030	ATA	2	6	3331739	3331744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21026	NC_021030	CCGC	2	8	3331824	3331831	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21027	NC_021030	CG	3	6	3331834	3331839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21028	NC_021030	TCG	2	6	3332019	3332024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21029	NC_021030	TCA	2	6	3332026	3332031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21030	NC_021030	CGT	2	6	3332090	3332095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21031	NC_021030	CCTT	2	8	3332118	3332125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21032	NC_021030	GAT	2	6	3332222	3332227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21033	NC_021030	TCG	2	6	3332257	3332262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21034	NC_021030	GAC	2	6	3332358	3332363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21035	NC_021030	TGC	2	6	3332436	3332441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21036	NC_021030	GACC	2	8	3332458	3332465	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21037	NC_021030	CGT	2	6	3332542	3332547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21038	NC_021030	TACC	2	8	3332587	3332594	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21039	NC_021030	GAA	2	6	3332652	3332657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21040	NC_021030	N	1422	1422	3332685	3334106	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21041	NC_021030	AAG	2	6	3334149	3334154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21042	NC_021030	CTGT	2	8	3334210	3334217	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21043	NC_021030	CTG	2	6	3334218	3334223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21044	NC_021030	G	8	8	3334225	3334232	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21045	NC_021030	CGA	2	6	3334307	3334312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21046	NC_021030	T	6	6	3334460	3334465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21047	NC_021030	TTG	2	6	3334507	3334512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21048	NC_021030	TTG	2	6	3334669	3334674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21049	NC_021030	ATA	2	6	3334713	3334718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21050	NC_021030	A	6	6	3334735	3334740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21051	NC_021030	TAT	2	6	3334754	3334759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21052	NC_021030	AATTA	2	10	3335828	3335837	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21053	NC_021030	T	6	6	3335895	3335900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21054	NC_021030	ATAA	2	8	3335901	3335908	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21055	NC_021030	N	441	441	3335910	3336350	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21056	NC_021030	GT	3	6	3336371	3336376	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21057	NC_021030	T	6	6	3336434	3336439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21058	NC_021030	AAT	2	6	3336504	3336509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21059	NC_021030	CGA	2	6	3336553	3336558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21060	NC_021030	TA	3	6	3336630	3336635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21061	NC_021030	ATCGA	2	10	3336834	3336843	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21062	NC_021030	GAA	2	6	3336864	3336869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21063	NC_021030	TGC	2	6	3337102	3337107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21064	NC_021030	AATG	2	8	3337151	3337158	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21065	NC_021030	ATC	2	6	3337177	3337182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21066	NC_021030	GAA	2	6	3337338	3337343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21067	NC_021030	TTA	2	6	3337371	3337376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21070	NC_021030	CAGGG	2	10	3337462	3337471	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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21084	NC_021030	TAC	2	6	3338112	3338117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21088	NC_021030	TA	3	6	3338273	3338278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21089	NC_021030	TTC	2	6	3338296	3338301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21092	NC_021030	A	6	6	3338372	3338377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21093	NC_021030	AATA	2	8	3340543	3340550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21094	NC_021030	GTT	2	6	3340598	3340603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21095	NC_021030	GA	3	6	3340636	3340641	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21096	NC_021030	GAA	2	6	3340791	3340796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21097	NC_021030	TGAAT	2	10	3340809	3340818	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21098	NC_021030	TGA	2	6	3340847	3340852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21099	NC_021030	CCG	2	6	3340909	3340914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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21102	NC_021030	CTAC	2	8	3341077	3341084	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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21105	NC_021030	N	381	381	3341191	3341571	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21106	NC_021030	ATCT	2	8	3341586	3341593	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21107	NC_021030	GCGG	2	8	3341598	3341605	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21108	NC_021030	T	6	6	3341606	3341611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21109	NC_021030	GCG	2	6	3341639	3341644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21110	NC_021030	GTC	2	6	3341682	3341687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21115	NC_021030	GAGC	2	8	3345820	3345827	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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21118	NC_021030	GAA	2	6	3345859	3345864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21119	NC_021030	CCG	2	6	3345892	3345897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21120	NC_021030	TTG	2	6	3345901	3345906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21121	NC_021030	ATAA	2	8	3345948	3345955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21122	NC_021030	CAT	2	6	3346049	3346054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21124	NC_021030	GCG	2	6	3348611	3348616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21125	NC_021030	TTA	2	6	3349523	3349528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21126	NC_021030	CGC	2	6	3351391	3351396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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21128	NC_021030	GGT	2	6	3351724	3351729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21129	NC_021030	CAG	2	6	3351771	3351776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21130	NC_021030	GCG	2	6	3351814	3351819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21131	NC_021030	ACA	2	6	3351846	3351851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21159	NC_021030	AT	3	6	3355238	3355243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21160	NC_021030	ATCC	2	8	3355306	3355313	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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21252	NC_021030	TAA	2	6	3368731	3368736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21253	NC_021030	AC	3	6	3368740	3368745	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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21384	NC_021030	ACCG	2	8	3396774	3396781	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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21386	NC_021030	A	8	8	3397776	3397783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21387	NC_021030	T	6	6	3401240	3401245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21500	NC_021030	T	6	6	3450141	3450146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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